Africa-Places.com a répertorié environ 12 les universités dans Cotonou. Certains des mieux notés les universités dans Cotonou sont- University Institute "Les Cours Sonou", UNIVERSITÉ DE FORMATION ESPAM, ISCG BENIN UNIVERSITY, ESGT BÉNIN, ESEP LE BERGER, ESCAE-Université Bénin Campus Cotonou, UNIVERSITE LA HEGJ BENIN, Université Africaine du Bénin Campus Akpakpa, Ecole Africaine d'Economie & École supérieure de Management (ESM).